Poseban porez plaća se prema odredbama dvaju propisa i to sukladno Zakonu o posebnom porezu na plaće, mirovine i druge primitke te Zakonu o plaćanju posebnog poreza na primitke od samostalne djelatnosti i ostale primitke.
Od kako je započelo plaćanje posebnog poreza na primitke od samostalne djelatnosti i ostale primitke, javlja se dvojba na koji uplatni račun odnosno poziv na broj porezni obveznici trebaju uplatiti obračunani posebni porez. Uplatni račun propisan je Naredbom o izmjeni i dopuni naredbe o načinu uplaćivanja prihoda proračuna, obveznih doprinosa te prihoda za financiranje drugih javnih potreba u 2009. godini (Nar. nov., br. 94/09.). Ta objava je izazvala dvojbu glede naziva računa i poziva na broj ( 1902-poseban porez na plaće, mirovine i druge primitke). Naime, naziv uz poziv na broj je različit u odnosu na poseban porez koji se plaća na primitke od samostalne djelatnosti i ostale primitke. S obzirom na to da je prema obje osnove plaćanja posebnog poreza utvrđena jednaka zakonodavna praksa posebni porez se plaća na jednak uplatni račun kao i za plaće, druge dohotke i sl.. Navedeno potvrđuje i Ministarstvo financija svojim mišljenjem.
Dakle, posebni porez je prihod državnog proračuna te se uplaćuje za sve vrste dohotka i primitaka na slijedeći račun:
| 1001005-1863000160 |
| 21 | 1902-MB (osam znamenaka) |
| 22 | 1902-MBG (trinaest znamenki) |
