Ovim Pravilnikom propisuje se postupak i način korištenja prava na porez po tonaži broda vezano za prijavu u sustav, plan ukrcaja vježbenika, prijavu dodatnih brodova, prijavljivanje promjena, primjenu načela nepristrane transakcije, prijavu nastavka sudjelovanja u sustavu, gubitak prava na porez po tonaži.
Ovaj Pravilnik stupa na snagu 20. srpnja 2013., a može se vidjeti ovdje.